Seiring perkembangannya, UPR telah memiliki program magister (S-2). Terdiri dari Magister Sains dan Manajemen, Magister Pengelolaan Sumber Daya Alam dan Lingkungan, Magister Pendidikan Bahasa Inggris, Magister Pendidikan Luar Sekolah, Magister Pendidikan Kimia, dan Magister Pendidikan Biologi.
Kemudian pada 2016, melalui Kementerian Riset, Teknologi, dan Pendidikan Tinggi, UPR mendapat izin membuka program doktoral (S-3) yakni Program Doktoral Ilmu Lingkungan. Kini UPR juga tengah menyiapkan pembukaan program studi baru, yakni Program Doktoral Ilmu Manajemen dan Program Doktora Ilmu Hukum. (sma/ce/ala)
